Πανομοιότυπο εξωτερικά με αυτό της Ιστορίας της Τέχνης και δίπλα σε αυτό καθώς τα χωρίζει η πλατεία της Μαρίας Θηρεσίας, άνοιξε τις πύλες του το 1889 και είναι και αυτό εκ των πλέον σημαντικών στο είδος του. Οι συλλογές που φιλοξενούνται στο Μουσείο Φυσικής Ιστορίας διαθέτουν μεγάλη θεματική ποικιλία καθώς περιλαμβάνουν ορυκτά, γεωλογικά, ζωολογικά και ανθρωπολογικά εκθέματα.
Στο τμήμα παλαιοντολογίας φυσικά θα έχετε την ευκαιρία να δείτε από κοντά σκελετούς δεινοσαύρων, ενώ οι μικροί σε ηλικία επισκέπτες θα λατρέψουν τις αίθουσες ζωολογίας που βρίσκονται στον πρώτο όροφο. Μεγάλο ενδιαφέρον επίσης συγκεντρώνουν τα αντικείμενα από την εποχή του Χαλκού και τα προϊστορικά δημιουργήματα του ανθρώπου, καθώς και οι αίθουσες που επιδεικνύουν την εξέλιξη τους είδους μας.
Η είσοδος για τα παιδιά είναι δωρεάν στο συγκεκριμένο μουσείο, ενώ οι ενήλικες θα πρέπει να καταβάλουν το ποσό των 10 ευρώ. Να υπολογίζετε πως θα χρειαστείτε τουλάχιστον 2-3 ώρες προκειμένου να εξερευνήσετε όλες τις συλλογές.